- « Le travail en économie et en physique », Journée mensuelle Rehseis, Février 1994
- « Vitalisme et pensée de la mort chez Bichat », Séminaire d’histoire de la biologie du Rehseis, Paris, 25 février 1996
- « Bichat et Lamarck », Séminaire Lamarck du Rehseis, Gayon, Gohau, Corsi dir., Paris, Juin 1999
- « Kant et l’épigenèse », Journées annuelles de la Société d’Histoire et d’Epistémologie des Sciences de la Vie, Montpellier, 4 mars 2000
- « Le modèle de l’économie animale et la naissance de la psychiatrie », Journées annuelles de la SHESVIE, Lille, 27 octobre 2001
- « L’économie animale comme schème de l’histoire naturelle de l’homme au XVIIIème siècle », Séminaire d’histoire et de philosophie de la biologie, Rehseis, 21 décembre 2001
- « Bichat et la naissance de la physiologie expérimentale », Séminaire d’histoire des sciences du centre Viète, Faculté de Nantes, avril 2002
- « Les théories de la mort : le changement néo-darwinien », Journées annuelles de la SHESVIE, Paris, 19-10-2002
- « La téléologie dans la biologie naissante », Séminaire d’histoire et philosophie de la biologie, Rehseis, 28 mai 2003
- « Ecrire le cas : Pinel aliéniste», Journée Médecins idéologues, dir. Béatrice Didier, Ecole Normale Supérieure, 12 décembre 2003
- « De l’adaptation », Congrès de la SHESVIE, Nantes, 19 mars 2004
- « Le concept d’espèce chez Kant et Buffon », Séminaire d’histoire et philosophie de la biologie, Rehseis, 13 février 2004
- « Le projet aliéniste, la nosologie et la décomposition des foncions mentales », Colloque Histoire de la psychopathologie : mythes, fonctions, traditions, Université de Lille, 25 novembre 2005
- « Adaptation, optimalité sélection », Séminaire de philosophie des sciences de l’IHPST, Paris, 5 décembre 2005
- « Explications causales et explications sélectionnistes », Séminaire de philosophie de la biologie, Paris, 23 février 2006
- « Naturalist philosophies and Kant’s theory of science », Journée philosophie et chimie au 18ème, org. B. Joly, Université Lille III, June 11, 2007
- « Conception computationnelle de l’émergence », Académie interdisciplinaire des sciences, Paris, June 12, 2007
- « Problèmes philosophiques de la théorie de l’évolution », Séminaire annuel de recherche de l’hôpital Saint-Antoine, Paris, October 19, 2007
- « La stabilité des écosystèmes – de l’écologie à l’éthique de l’environnement », présentation d’un projet with Minus Van Baalen (éco-évolution mathématique, ENS/Paris VI), Colloque Philosophie de l’environnement et du développement durable, Aix en Provence, 31 janvier 2008
- « Adaptation : perspectives épistémologiques », Ecole thématique interdisciplinaire de biologie du CNRS, Berder, 31 March 2008
- « Robustesse et évolvabilité », with Sara Franceschelli and debate with the audience, Ecole thématique interdisciplinaire de biologie du CNRS, Berder, 1 avril 2008
- « Adaptation et transitions évolutionnaires », PhilBio, IHPST, 29 Mai 2008
- « Les modèles et les simulations en biologie », Les modèles en physique, Association pour la physique Fondamentale, Bibliothèque nationale de France, Paris, dec. 10, 2008.
- « Modelizing lymphocyte cancer: epistemological challenges » Presentation of the Leucemia project with L.Vallat and V. Schächter, Paris, ISC, dec 15, 2008
- « Combinatoire et computation : le concept formel de l’émergence », L’émergence, Académie interdisciplinaire des sciences, Paris, 15-12-2008
- « Ce qu’apporte la théorie évolutionniste de la coopération à la philosophei de l’environnement. » Rencontres philosophie et décision autour du changement climatique. Aix en Provence, December 1-3 2008.
- « Stability of ecosystems : an interdisciplinary project » (with Minus Van Baalen; poster). Colloque Ingénierie écologique. INEE, CNRS, Paris, March 31, 2009
- « Ecological interactions and the biological hierarchies. » Ecole thématique Paradigmes de l’écologie, Cargese, March 7, 2009.
- « Sur l’éthique évolutionniste » Séminaire Produire l’éthique, Paris 3 juin 2009« Problèmes de la théorie de l’évolution », Séminaire de philosophie de la biologie de l’Ecole Normale Supérieure, 13 mai 2004
- “Gilbert Ryle. L’explication dispositionnelle en psychologie”, Séminaire Histoire de la notion de fonction, dir. F. Parot, Octobre 2004
- « Deux conceptions de la normalité », Séminaire de S. Bosselet, Collège international de philosophie, 14 décembre 2004
- “Pourquoi ne fait-on pas de montres en caoutchouc ?” Conférence de la société de philosophie des sciences, « Le tout et les parties », Paris, 22 janvier 2005
- Présentation critique de J.Zammito, A nice derangement of epistemes (University of Chicago Press, 2005), séminaire bibliographique du REHSEIS, 8 février 2005
- Atelier « L’explication fonctionnelle », La notion de fonction en neuroanatomie fonctionnelle, J. Gayon, O. Houdé (org.), Paris, 11 février 2005
- « De l’histoire de l’organisme à la philosophie de la biologie : fonction, sélection, adaptation », Séminaire mensuel REHSEIS.
- Présentation critique de R. Batterman, Devil in the details (Oxford University Press, 2005), Rehseis, 16 Mai 2006
- “Finalité et fonction, de Kant à Cuvier”, Journée “La fonction dans la biologie du XIXème siècle”, 26 septembre 2006, Paris 7 (ACI fonction).
- « Design et lois naturelles » Séminaire Mythologies scientifiques, Execo, Paris I, 16 décembre 2006.
- « Modèles et simulations en écologie », Séminaire du laboratoire d’écologie de l’ENS, dir. R.Ferrière, 19 décembre 2006.
- « Determinism and prediction », Berder, CNRS summer school in Biology, March 2007
- « De la conception religieuse de la folie à la manie religieuse », Science et religion au XVIIIème siècle, Paris, Rehseis, June 4, 2007.
- Regards sur les Naturphilosophen et les Transformismes prédarwiniens » Colloque Cent cinquante ans après l’Origine des espèces: du darwinisme de Darwin à l’évolutionnisme contemporain. Paris, Collège de France, June 10-12, 2009.
- « La sélection naturelle dans le darwinisme : concepts et controverses » Darwinisme, Unité de génétique animale, Agro Paris Tech, 9 octobre 2009.
- « La théorie évolutionniste du développement et la Synthèse Moderne. » Séminaire Biologie et société, MSH, mai 2010.
- « Evolution, simulation et niveaux de causalité » Atelier Causalité et modèles en science. Université de Dijon, 10 juin 2010
- « Individualité faible : écosystèmes et organismes » Centre de Recherches Interdisciplinaires, Paris Hôpital Cochin, 26 janvier 2011.
- « Adaptation et hérédité chez Kant », Colloque Kant et les races, Paris, 29 janvier 2011.